作为“十三五”时期国家优先安排建设的重大科技基础设施，该项目面向超越当前粒子物理标准模型的新粒子和新物理的重大基础前沿研究，开展暗物质直接探测实验、无中微子双贝塔衰变实验、核天体物理领域关键核素合成过程以及恒星演化等基础科学前沿研究，在极深地下、近零宇宙射线本底条件下，探究各类基础前沿领域探测的新机理、新方法、新技术，发展极低辐射本底屏蔽新方法与新技术，为我国粒子物理和核物理领域的重大基础前沿物理问题研究提供平台支撑。

　　2009年，清华大学与雅砻江流域水电开发有限公司合作，在锦屏山隧道中间位置的地下2400米处修建极深地下实验室，2010年底建成投入使用。与国际上其他的地下实验室相比，中国锦屏地下实验室岩石覆盖最深、宇宙线通量最小、可用空间最大。